1........10........20........30........40........50........60........70........80........90.......100.......110.......120.......130.......140.......150.......160.......170.......180.......190.......200.....
Methanospirillum -U--C---------AAU---A----G--CGGCCACAG-CAGGU---GUG-UC-ACACCCGUUCCCAUUCCGAACAC-GGAAGUUAAGACACCUCACGUG-----GAUGA-C-G-GUACUG---AGG--UACGCGAGUCCUCGGGAAA---UCA--U------------C-CUCGCUG----C-U-AU---UGUU------------
Haloarcula ----U---------U-A---G----G--CGGCCACAG-CGGUG---GGG-UUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACAC-GGAAGAUAAGCCCACCAGCGUU-----CCGGG-G-A-GUACUG---GAG--UGCGCGAGCCUCUGGGAAA---CGC--G------------G-UUCGCCG----C-C-------ACC------------
Halobacterium ----U---------UAA---G----G--CGGCCAUAG-CGGUG---GGG-UU-ACUCCCGUACCCAUCCCGAACAC-GGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUU-----CCGGU-C-A-GUACUG---GAG--UG--CGAGCCUCUGGGAAA---UCC--G------------G-UUCGCCG----C-C------UACU------------
Haloferax ----U---------UAA---G----G--CGGCCAGAG-CGGUG---AGG-UU-CCACCCGUACCCAUCCCGAACAC-GGAAGUUAAGCUCACCUGCGUU-----CUGGU-C-A-GUACUG---GAG--UGAGCGAUCCUCUGGGAAA---UCC--A------------G-UUCGCCG----C-C-------CCU------------
Halorubrum -G------------U-A---G----G--CGGCCAAAG-CGGCA---GGG-AA-AGACCCGUACCCAUUCCGAACAC-GGAAGUGAAGCCUGCCAGCGUA-----CCAGC-U-A-GUACUG---GAG--UGGGAGACCCUCUGGGAGC---GCU--G------------G-UUCGCCG----C-C---------UACUC--------
Natrinema ----U---------UAC---G----G--CGGCCACAG-CGGCG---AGG-UA-CCUCCCGUACCCAUCCCGAACAC-GGAAGAUAAGCUCGCCUGCGUU-----UCGGU-C-A-GUACUG---GAG--UGGGCGACCCUCUGGGAAC---CCC--G------------A-UUCGCCG----C-C-------ACCACU-C-------
Methanolobus -G--G-----------U---G----G--CGGCCAUAG-CGGCG---GGG-CA-AUUCCUGUACCCAUCCCGAACAC-AGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUU-----CUAUA-C-U-GUACUA---AAG--UAUGAGAGUCUUUGGGAAA---UAU--G------------G-AACGCUG----C-C-AC---CAAC------------
Methanosarcina -GGAG---------UUU---G----G--C-GCCAUAG-CGGCA---GUG-UA-ACUCCUGUACCCAUCCCGAACAC-AGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUU-----CCUUA-C-U-GUACUG---AAG--UGUGCGAGCCUUCGGGAAC---UCU--G------------G-AUCGCUG----C-C-AUACUCACC------------
Methanosarcina.v -G--A---------UCU---G----G--CAGCCAUAG-CGGCAG--GUG-UA-A-UCCUGUACCCAUCCCGAACAC-AGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUU-----CCUUGCC-U-GUACUG---AAG--UGUGCGAG-CUUCGGGAAC---UCU--G------------G-AUCG-UG----C-C-AUA-UCAGU------------
Nanoarchaeum -G--U---------UUC---GUGGGA--GGGCCAUAG-CGGCC-C-GGG-AA-CCACCCGUACCCAUCUCGAACAC-GGAAGUUAAGCCGGGCCGCGUC-----CCGAG-U-G-GUACUG-----C--CCCGCGAAGGGGUGGGAAG---CUC--G------------G-GAUGC--------C---------C------------
Thermoplasma -G--G---------CA---------A--CGGUCAUAG-CAGCA---GGG-AA-ACACCAGAUCCCAUUCCGAACUC-GACGGUUAAGCCU-GCUGCGUA-----UUGCG-U-U-GUACUG---UAU--GCCGCGAGGGUACGGGAAG---CGC--A------------A-UAUGCUG----U-U-AC---CACU------------
Pyrococcus -G--G---------UAC---G----G--CGGUCAUAG-CGGGG---GGG-CC-ACACCCGGUCUCAUUUCGAACCC-GGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAU-----CCCGG-C-U-GUACUG---CCC--UCCGAGAGGGGGCGGGAAC---CG---G------------G-GACGCCG----C-C-GG---CCA-------------
Thermococcus -G--G---------UAC---G----G--CGGUCAUAG-CGGCG---GGG-UC-ACACCCGGUCUCGUUUCGACCCC-GGAAGUUAAGCCCGCCAGCGAU-----CCCGG-U-U-GUACUG---CCC--UCCGGGAGGGGGCGGGAAC---CG---G------------G-GACGCCG----C-C-GG---CCAC------------
Methanococcus UG--A---------CAU---A----A--CGGUCAAAG-CGGAG---GUG-UA-ACAUCCGAUCCCAUCCCGAUCUC-GGAAAUUAAGCCCUCCAGCGAU-----UCUUU-A-A-GUACUG---CUA--UCU-------AGUGGGAAC---AAA--G------------U-GACGCCG----U-U-AG---UCAC------------
Methanothermococcus UG--A---------UAU---A----A--CGGUCAUAG-CGGAG---GAG-CC-ACAUCCGAUCCCGUCCCGAUCUC-GGAAAUUAAGCCCUCCAGCGAU-----ACCCU-A-A-GUACUG---CCA--UUU-------GGUGGGAAC---AGG--G------------U-GACGCUG----U-U-GA---UCAC------------
Methanothermobacter -G--U-----------U---G----G--CGGUCAUGG-CGUGG---GGU-UU-AUACCUGAUCUCGUUUCGAUCUC-AGUAGUUAAGUCCUGCUGCGUU-----GUGGG-U-GUGUACUGCGGUUU--UUUG-----CUGUGGGAAG---CCC--A------------C-UUCACUG----C-C-AG---ACAA------------
Methanothermus -G--G---------UAC---G----G--CGACCAUAG-CGGGG---GGG-CC-ACACCUGAACCCGUUCCGAUCUC-AGAAGUUAAGCCCCCCUGCGUU-----GGAGG-U-G-GUACUG---CAACGUUAG-----UUGCGGGAAG---CCU--C------------C-AACGUCG----C-C-GG---CCCA------------
Campylobacter -A--U---------GUC---C----G--UGAUUAUAC-AGAUG---UGG-AA-ACGCCUUGCUCCAUCCCGAACCA-AGAAGCUAAGCACAUCGUGGGUGAU----------G-AUACUA---CGC---------CUUA--------CUGGCA--GGGGGAAAGUAG---CUCAUUG----C-G-GA---CUU-------------
Chlamydia --------------CUU---G----G--UGAUAAUAG-AGAGA---GGG-AA-ACACCUGACACCAUUCCGAACUC-AGAAGUUAAGCCUCUGAUCGCUGAU----------G-GUACUA---UAC-----------AC--------AAGAGU--AUGGGAGAGUAG---GUCGUCG----C-C-AA---GCA--------U----
Streptomyces -G--U---------UUC---G----G--UGGUCAUAG-CGUUA---GGG-AA-ACGCCCGGUUACAUUCCGAACCC-GGAAGCUAAGCCUUACAGCGCCGAU----------G-GUACUG---CAG---------GGGG--------GACCCU--GUGGGAGAGUAG---GACGCCG----C-C-GA---ACA-------------
Agrobacterium -----CGA------CCU---G----G--UGGUCAUCG-CGGGG---CGG-CU-GCACCCGUUCCCUUUCCGAACAC-GGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAU----------G-GUACUU---CGU-----------CU--------CAAGAC--GCGGGAGAGUAG---GUCGCUG----C-C-AG---GUC------U------
Escherichia --------UG----CCU---G----G--CGGCCGUAG-CGCGG---UGG-UC-CCACCUGACCCCAUGCCGAACUC-AGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAU----------G-GUAGUG---UG----------GGGU--------CUCCCC--AUGCGAGAGUAG---GGAACUG----C-C-AG---GCA------U------
Thermus ----------AAUCCCC---C----G--UGCCCAUAG-CGGCG---UGG-AA-CCACCCGUUCCCAUUCCGAACAC-GGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAU----------G-GUACUG---GGC---------GGGC--------GACCGC--CUGGGAGAGUAG---GUCGGUG----C-G-GG---GGA------U------
Aquifex -C--C---------CCU---G----G--UGGCCAUAG-CGGGG---GGG-AA-ACACCCGGUCCCAUUCCGAACCC-GGCAGUUAAGCCCCCCAGCGCCGAU----------G-AUACUG---UGC---------CGGC--------AGCGGC--ACGGGAAAGUAG---GUCGCUG----C-C-AG---GGG-------------
Thermotoga -A--U---------CCCCG-G----G--UGCCGAUAC-UGGGG--CGGG-AA-ACACCCGGUUCCAUUCCGAACCC-GGCCGUUAAGCCGCCCUGGGCCGAU----------G-GUAGUA---UGG---------GGGC--------AGCCCC--AUGCGAGAGUAG---GUAGCGC----C-C-GG---GGA-------U-----
Bacillus --------------UUU---G----G--UGAUGAUGG-CAGAG---AGG-UC-ACACCCGUUCCCAUACCGAACAC-GGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAU----------G-GUAGUU---GGG-----------AC--------C-UUGUCCCUGUGAGAGUAG---GACGUCG----C-C-AA---GC--------------
Geobacillus --------------CCU---A----G--UGGUGAUAG-CGGAG---GGG-AA-ACACCCGUUCCCAUCCCGAACAC-GGAAGUUAAGCCCUCCAGCGCCGAU----------G-GUAGUU---GGG-----------GC--------CAGCGCCCCUGCAAGAGUAG---GUCGCUG----C-U-AG---GC--------------
Flavobacterium --------------UAA---G----G--UGGUUAUUG-CGGCG---GGG-CU-CGACCUCUUCCCAUCCCGAACAG-AGUAGUUAAGCCCGCCUGCGCAGAU----------G-GUACU------------------GC--------AGUUAU--GUGGGAGAGUAU---GUCGUCG----C-C-UU---UC--------------
Spirochaeta --------------CCU---G----G--UGAUCAUAG-CGAAG---AGG-UC-CCACCCGUUCCCAUCCCGAACAC-GGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAU----------G-GUACU------------------GC--------UAUUGC----GGGAGAGUAG---GUCGUCG----C-C-AG---GC----------U---
Archeoglobus -A--U---------GCC---G----A--CGGUCAUAG-GACGG---GGG-AA-ACACCCGGACUCAUUCCGAACCC-GGAAGUUAAGCCCCGUUCCGUC-----CCGCA-C-A-GUACUG---UGU--UCCGAGAGGGCACGGGAAC---UGC--G------------G-GA-ACCG----U-C-GG---CUU-------------
Pyrobaculum -G--C---------CCC--UA----ACCCGGCCAUAGGCGCCG---GUG-AU-ACGCCCGGUCUCAUCA-GAACCC-GGAAGCUAAGGCCGGCGCCGCG-----CUCGG-G-A-GUACUG---GGC--UCCGCGAGGGCCCGGGAAA---CCG--G------------C-GU-GCUGGGA-G-GGGG---CUU-------------
Desulfurococcus -U--G---------CCC---G----ACCCGGCCAUAG-UGGCC---GGG-CA-ACACCCGGUCUCGUUUCGAACCC-GGAAGUUAAGCCGGCCA-CGUC---AGAACGG-C-C-G---UG---AGG--UCCGAGAGGCCUCGC-AGC---CGU--U-----------CU-GA-GCUGGGA-UCGGGC---ACC-------------
Sulfolobus -G-------------CC---C----ACCCGGUCACAG-UGAGC---GGG-CA-ACACCCGGACUCAUUUCGAACCC-GGAAGUUAAGCCGCUCA-CGUU---AGUGGGG-C-C-G---UG---GAU--ACCGUGAGGAUCCGC-AGC---CCC--A-----------CU-AA-GCUGGGA-U-GGGU---UUU-------------
Gelidium -A--C---------AU---------U--CGGCCAUAC-UAAGU---CGACAU-GUACCCGAUCCCAUCCCGAACUC-GGAAGUCAAGUCGCUUCAGGC------CGGGU-U-A-GUACUG---AGG--UGAGGGAUCACUCGGGAAU---CCC--C------------G-GU-GCCG----A-A---------UG--------U--
Cryptosporidium -G--C---------AA---------U--CGGCCAUAC-UACAU---CGA-AU-AUACCGGAUCCCAUCA-GAACUC-CGAAGUCAAGCGGUGUAAGGU------UCGGU-U-A-GUACUA---GGG--UGGGGGACCACCUGGGAAG---ACC--A------------GAAU-GUCG----A-U---------CGCC------UC-
Nosema -G------------AU---------A--CGGUUAUAU-UUACU---GAA-AA-CCACCGGAACCCAUCA-GAACUC-CGAAGUUAAACCAGUAUGAGC------UUAAU-U-A-GUACUA---AGA--AGGGAGACCACUUGGGAAC---GUU--G------------G-GU-G------GU-A----------------------
Zea -G--G---------AU---------G--CGAUCAUAC-CAGCA---CUA-AA-GCACCGGAUCCCAUCA-GAACUC-CGAAGUUAAGCGUGCUUGGGC------GAGAG-U-A-GUACUA---GGA--UGGGUGACCUCCUGGGAAG---UCC--U------------C-GU-GUUG----C-A---------UUCC---------
Euglena -G--A---------GU---------A--CGGCCAUAC-UACCG---GGA-AU-ACACCUGAACCCGUUC-GAUUUC-AGAAGUUAAGCCGGGUUAGGC------CCAGU-U-A-GUACUG---AG---UGGGCGACCACUUGGGAAC---ACU--G------------G-GU-GCUG----U-A---------CGCU------U--
Caenorhabditis -G--C---------UU---------A--CGACCAUAU-CACGU---UGA-AU-GCACGCCAUCCCGUCC-GAUCUG-GCAAGUUAAGCAACGUUGAGU------CCAGU-U-A-GUACUU---GGA--UCGGAGACGGCCUGGGAAU---CCU--G------------G-AU-GUUG----U-A---------AGC-------U--
Drosophila -G--C---------CA---------A--CGACCAUAC-CACGC---UGA-AU-ACAUCGGUUCUCGUCC-GAUCAC-CGAAAUUAAGCAGCGUCGGGC------GCGGU-U-A-GUACUU---AGA--UGGGGGACCGCUUGGGAAC---ACC--G------------C-GU-GUUG----U-U---------GGCC------U--
Xenopus -G--C---------CU---------A--CGGCCAUAC-CACCC---UGA-AA-GUGCCCGAUAUCGUCU-GAUCUC-GGAAGCCAAGCAGGGUCGGGC------CUGGU-U-A-GUACUU---GGA--UGGGAGACCGCCUGGGAAU---ACC--A------------G-GU-GUCG----U-A---------GGCU------U--
Cryptobranchus -G--C---------CU---------A--CGGCCAUAC-CACCC---UGA-AU-GCGCCCGAUCUCGUCU-GAACUC-AGAAGCUAAGCAGGCUUGGGC------CUGGU-U-A-GUACUU---GGA--UGGGAGACUGCCUGGGAAU---ACC--A------------G-GU-GCUG----U-A---------GGCU------U-U
Homo -G--U---------CU---------A--CGGCCAUAC-CACCC---UGA-AC-GCGCCCGAUCUCGUCU-GAUCUC-GGAAGCUAAGCAGGGUCGGGC------CUGGU-U-A-GUACUU---GGA--UGGGAGACCGCCUGGGAAU---ACC--G------------G-GU-GCUG----U-A---------GGCU------U-U
Dictyostelium -G--U---------AU---------A--CGGCCAUAC-UAGGU---UGG-AA-ACACAUCAUCCCGUUC-GAUCUG-AUAAGUAAAUCGACCUCAGGC------CUUCC-A-A-GUACUC---UGG--UUGGAGACAACAGGGGAAC---AUA--G------------G-GU-GCUG----U-A---------UACU---------
Physarum -G--G---------AU---------G--CGGCCAUAC-UAAGG---AGA-AA-GCACCUCAUCCCGUCC-GAUCUG-AGAAGUUAAGCUCCUUCAGGC------GUGGU-U-A-GUACUG---GGG--UGGGGGACCACCUGGGAAU---CCC--A------------C-GU-GCUG----C-A---------UUCU------U--
Amoebidium -G--G---------UU---------A--CGGCCAUAC-CUAGC---AGA-AA-GCACCCCAUCUCGUCC-GAUCUG-GGAAGUUAAACUGCUAUGGGC------GUGGU-U-A-GUACUG---CGG--UGGGGGACCACGCGGGAAU---ACC--A------------C-GU-GCUG----U-A---------AUCU---------
Candida -G--G---------UU---------G--CGGCCAUAU-CUAGC---AGA-AA-GCACCGUUCCCCGUUC-GAUCAACCGUAGUUAAGCUGCUAAGAGC------AAUAC-CGA-GUAGUG---UAG--UGGGAGACCAUACGCGAAA---CUA--U------------U-GU-GCUG----C-A---------AUCU---------
Saccharomyces -G--G---------UU---------G--CGGCCAUAU-CUACC---AGA-AA-GCACCGUUCUCCGUCC-GAUCAACUGUAGUUAAGCUGGUAAGAGC------CUGAC-CGA-GUAGUG---UAG--UGGGUGACCAUACGCGAAA---CUC--A------------G-GU-GCUG----C-A---------AUCU---------